第一次魔女战争：市场与学会合作打败了魔女，统治了绮礼镇，魔女离开绮礼镇。
魔女事件：学会挖掘出绮礼镇地下被封印的“魔女之神爱丽丝”，无数魔女开始在绮礼镇出生，后世称为“魔女事件”。
魔女事件后，学会和市场为了防止魔女威胁统治和利用魔女的力量，对魔女开始了残酷的迫害，作为魔女出生的孩子成为魔女猎人和奴隶商人的猎物，处境悲惨。
暗之魔女一族与学会合作研究“现实改变魔法”
爱丽丝作为魔女之神的巫女被学会收养，进行利用神的力量的实验。
爱丽丝与卡特琳娜在学会设施相遇，两人产生了友谊。
爱丽丝帮助遭受非人道实验的卡特琳娜逃离设施。
卡特琳娜被奴隶商人抓住，因为不死的能力被培养为市场的杀手。
绮礼镇外的线之魔女蕾雅无法看着同胞被迫害，孤身一人回到绮礼镇对抗市场和学会。
蕾雅救下了从设施逃出后被奴隶商人抓住的爱丽丝和其他魔女。
[绮礼镇战争篇]
卡特琳娜刺杀蕾雅失败，被捕获。
学会的魔女猎人与市场的军队来抓捕蕾雅，蕾雅被捕，卡特琳娜带着爱丽丝逃走。（绝望之战篇）
卡特琳娜营救蕾雅失败被捕并背叛爱丽丝，爱丽丝被市场抓住。
[历史分歧点]
爱丽丝拒绝了魔女之神的帮助，在绮礼镇战争战败并被俘虏，成为了被卡特琳娜饲养的奴隶。（37话）
爱丽丝使用魔女之神的力量与卡特琳娜一起营救被处刑的蕾雅。
战斗中蕾雅与坠星一起坠崖失踪，爱丽丝与卡特琳娜带领魔女打败了市场的首领，占领了灰堡。
爱丽丝继承了蕾雅的名字和梦想，成为了新的线之魔女。
蕾雅战胜并放逐了学会，解放了魔女之神，并称其为爱丽丝。
蕾雅建立了魔女集团，开始了对绮礼镇漫长的统治。
[现代篇]
暗之魔女一族在战后被清算，全族被消灭；无法控制自己身上的现实改变魔法的安娜在遭到其他魔女凌辱时使用能力创造了“光之魔女”的英雄小光，成为唯一的幸存者。
过去被凌辱的创伤让安娜创造出追捕她的模因生物“死灵术士”，安娜抛下保护她的小光逃走。
蕾雅与坠星在漫长的时间后醒来，他们失去了记忆，但仍然保留了一部分的能力。
他们化名为蛛后和七曜，开始寻找关于自己的线索。
在探索世界时，与对魔女的残暴统治不满的同伴相遇，创建了“变革者”组织。
安娜被七曜捡到，加入变革者组织，化名鬼猫。
七曜策划绑架了爱丽丝，并抓住了前来营救的卡特琳娜。
蕾雅救出了卡特琳娜，却落入了变革者的陷阱被捕获。
蕾雅遭到蛛后和七曜的拷问后，精神崩溃，堕落为“血红之线”。
逃走的卡特琳娜被发生政变的魔女集团捕获。
从地牢中被释放出来的剑之魔女白与血红之线战斗。
鬼猫前去营救卡特琳娜，遭遇被控制的小光和死灵术士，战败被捕。
在死灵术士的折磨下，鬼猫放弃了自己，迷失在过去的创伤中。
死灵术士夺取了她的能力，并和七曜合作，通过卡特琳娜的梦境寻找过去的线索。
卡特琳娜在爱丽丝的帮助下逃脱，并亲手斩杀“血红之线”。
卡特琳娜梦境中的爱丽丝在与魔女之神交流中产生了自我意识，为了规避未来的坏结局选择放弃抵抗，与世界和解，成为了世界的一部分。
历史改变，爱丽丝（未来的蕾雅）与爱丽丝（魔女之神）告别。
—— 完 ——