30 萧衍攻克江州、郢州之后，萧宝卷驰骋游玩如故，对茹法珍说：“等他来到白门前，再一决胜负。”萧衍到了建康附近，萧宝卷才集结部队，准备固守，在左、右尚方监狱及东、西两个冶炼场监狱中简选囚徒充军。对一些不能让他活着的，就在朱雀门内斩首，一天斩了一百多人。
萧衍派曹景宗等进兵屯驻江宁。九月二十五日，李居士在新亭选拔精骑一千人，抵达江宁。曹景宗刚到，还未扎营，而且行军时间长了，武器盔甲都已破旧。李居士望见，有些轻视他们，鼓噪直前进逼。曹景宗奋击，击破李居士军，然后乘胜而前，一直冲到皂荚桥。于是王茂、邓元超、吕僧珍进兵占据赤鼻逻，新亭城主江道林引兵出战，就在阵前被众军生擒。萧衍抵达新林，命王茂进兵占据越城，邓元起占领道士墩，陈伯之占领篱门，吕僧珍占领白板桥。李居士侦察到吕僧珍兵少，率锐卒一万人直接前来攻营。吕僧珍说：“我军兵少，不可逆战，也不要远远地就射击，等他们到了壕沟里，再并力破敌。”过了一会儿，李居士军冲上来，开始越过壕沟，拔起栅栏。吕僧珍分兵上城墙，矢石俱发，自己率步骑兵三百人绕到敌人身后，城上的人又翻墙而下，内外奋击，李居士败走，缴获武器盔甲不可胜计。李居士向萧宝卷建议，烧毁南岸房屋，以开辟战场，于是自大航以西、新亭以北全部烧为灰烬。
萧衍的几个弟弟都从建康逃出来，投奔反抗军。
冬，十月十三日，皇帝萧宝卷派征虏将军王珍国、军主胡虎牙将精兵十万余人在朱雀桥南列阵，宦官王宝孙手持白虎幡督战，拉起吊桥，断绝归路，背水一战。萧衍军稍微退却，王茂下马，单刀直前，他的外甥韦欣庆手执铁缠槊（以铁丝缠绕矛把的长矛）在身旁掩护，冲击朝廷军，霎时冲进敌阵。曹景宗纵兵跟随，吕僧珍纵火焚烧其军营，将士皆殊死作战，鼓噪声震天地。王珍国等众军不能抵抗，王宝孙痛骂诸将帅，直阁将军席豪发愤突阵而死。席豪是骁将，他一死，士卒土崩，投入秦淮河淹死者无数，尸体堆积，和桥面一样高，后面的人就踩着尸体过河，于是朝廷诸军望之崩溃。萧衍军长驱至宣阳门，诸将也率军稍稍向前移动。
陈伯之屯驻在西明门，城中每有人出来投降，陈伯之就招呼他过来，耳语一番。萧衍担心他再倒戈，对他密语说：“听说城中对你献出江州投降非常忿恨，要派刺客来杀你，你一定要小心。”陈伯之不信。正巧朝廷军将领郑伯伦来降，萧衍派郑伯伦去找陈伯之，对他说：“城中非常恨你，要派使者来，以封赏引诱你，等你再投降过去，就要活活砍掉你的手脚。你如果不降，就再派刺客杀你。你一定要严加戒备。”陈伯之惧，自此死心塌地。
【华杉讲透】
要始终知道自己在做什么
《孙子兵法》说：“上兵伐谋，其次伐交。”萧衍这一手，就是既伐谋，又伐交。陈伯之儿子还在城内，他担心儿子安全，有可能再转投敌营。跟城里投降出来的人耳语，就是打听家里的情况。萧衍的“伐谋”，是伐掉陈伯之脑海里叛变的念头；“伐交”呢，就是使一个离间计，伐掉朝廷引诱陈伯之的可能性。
纵观这一战，双方主君都是昏君，都不知道自己在做什么。只有萧衍，自始至终脑子清醒，每一步都深谋远虑，处置恰当。所以最后他做了皇帝，也是天命了。
每个人都在做事，但知道自己在做什么就很难。萧衍就是始终知道自己在做什么的人。
十月十七日，宁朔将军徐元瑜献出东府城投降。青州、冀州二州刺史桓和入援京师，屯驻在东宫。十月十八日，桓和欺骗萧宝卷，说他出城作战，然后率众投降了萧衍。光禄大夫张瑰抛弃石头城回皇宫。李居士献出新亭，投降萧衍，琅琊城主张木也投降了。
十月二十一日，萧衍镇守石头城，命诸军攻六门。萧宝卷火烧门内营署、官府，驱逼士民，全部进入宫城，闭门自守。萧衍命诸军筑长墙包围。
