永仓新八在戊辰战争爆发后没多久便脱离了新选组，回到了江户。后来又做了杉村家的养子，以避免明治政府方面的缉捕。再后来他开了个剑道馆，教了一些徒弟，在这期间，他还为近藤勇和土方岁三修建了墓碑。

明治二十四年（1891），中日两国战争一触即发，此时已经52岁的永仓新八上书新政府，说要参加拔刀队，赴海外作战。明治政府那边效率还是蛮高的，没几天就回了一封信，大致内容是您老人家的心意我们领了，不过目前并不缺人手。也就是说算是婉言拒绝的意思。结果永仓新八看了信之后就哈哈大笑起来：“那些萨长的家伙们一定觉得借用新选组的力量是一件无比坍台的事儿吧。”

上了年纪之后的永仓新八终日呆在家里颐养天年，最大的兴趣爱好就是带着孙子们去电影院看电影。有一次，电影散场，他拄着拐杖颤颤巍巍地走出了影院，因为光差的缘故，所以一时间连步子都迈不稳了，一旁的孙子赶忙将其扶住，好不让他跌倒。此时，永仓新八长叹一声：“近藤和土方都死得太早啦，留下我一个孤苦伶仃的老头子活了那么久，不过也好，要不这样，我还看不到电影这种新奇玩意儿呢。”

刺眼的眼光照耀下，他仿佛已然老去，老到了让所有人都已经不认得的地步。

就在这个时候，周围走过来几个地痞，为首的那个嫌永仓他们家的那群人挡了道了，于是很嚣张地说死老头子你给我滚，好狗不挡道你不知道么？

永仓新八的唇角微微向上翘了翘，却没有挪动身子的打算。那位地痞似乎还想接着骂，可还没等张开嘴，他突然就愣住了。

因为永仓手里的那根手杖，突然就架在了他的脖子上，什么时候出的手，却没有任何人看清。

“滚。”

一个字，一道锐利的目光，一根手杖，眼前的那位老人似乎又回到了那个血风的京都时代，似乎又重新变回了新选组二番队队长。

永仓新八一直活到了大正四年（1915）的一月五日，因蛀牙引发了骨膜炎和败血症，经医治无效后病逝，享年77岁。