2003年，北京大学、清华大学、浙江大学等9所国内一流学府共同发起了“一流大学建设系列研讨会”。在2009年10月13日召开的第七届研讨会上，9所大学签订了《一流大学人才培养与交流协议书》，共同培养拔尖人才。根据协议书，9所高校将互相承认交换生在他校学习和交流期间取得的课程成绩与学分。
2008年起，常州高职园区内的五所高职院校和一所本科院校为了共享优质的教学与学习资源，满足学生个性化学习需求，探索多所院校共同培养学生的模式，构建了学分互认体系。学分互认分为两种情况：第一种是高职院校之间专科层次的学分互认，第二种是高职院校与本科院校的专科课程与本科课程之间的学分互认。主要以第一种情况为主。园区内学分互认体系的实施实现了优质资源共享，促进了教师之间的交流，提升了教师的教育教学水平，深化了教学模式改革，培养了既有理论知识又有一定实践经验的应用型和复合型人才，促进了院校办学水平的整体提升。[10]
（二）网络教育学分互认
教育部依托中国教育和科研计算机网，实现了异地学分互认制度，同时对新增的开展现代远程教育试点工作的25所高校也提出推动校际课程互选和学分互认的要求。作为跨地域多高校学分互认的第一案例，网络教育“课程互选、学分互认、联合办学”项目，旨在利用天地网远程教育平台，探索新型的网络教育联合办学模式。该项目涉及上海交通大学、西安交通大学、浙江大学、宁夏大学和西藏大学（以下简称“五校”）的普通高等教育和网络教育的学生。截至2004年9月底，96门课程列入五校教学计划，24791名学生共享选课41610门次，17056人次获得五校的学分。这是普通高等教育与网络教育之间衔接和沟通的一次尝试，为跨区域和跨教育类型的学分互认提供了经验，也为进一步的实践提出了体制上的要求。[11]
2007年5月，中国石油大学（华东）、北京交通大学、福建师范大学、西南科技大学、北京网梯科技发展有限公司联合发起成立“网络教育教学资源研发中心”。之后，中国石油大学（北京）、华南师范大学、华中科技大学、中国地质大学（北京）和西南大学先后加入研发中心。网络教育教学资源研发中心搭建了9所院校共建共享的学分互认平台。截至2018年6月，学分互认平台上线59门课程，选课次数达893519门次，参与学生人数为353242人，互认学分673394分。
2013年以来，我国大规模开放在线课程（MOOC，简称慕课）迅猛发展，推动跨校、跨地域学分互认深入发展，但社会学习者慕课学分的认可机制还有待探索。截至2018年4月，我国上线慕课数量达到5000门，高校学生和社会学习者选学人数突破7000万人次，超过1100万人次大学生获得慕课学分，中国高校慕课总量、参与开课学校数量、学习人数均处于世界领先地位。[12]
（三）专业技术资格和证书互认
2005年1月，珠三角各城市签署《珠三角人才资源开发一体化合作协议》，旨在推动区域内专业技术资格、职业资格证书互认以及区域内高级专家信息资源共享等，以实现人力资源的共享与合作。
2005年3月20日，上海、江苏、浙江、辽宁、吉林、黑龙江六省（市）人事部门的领导齐聚哈尔滨，签署了《“东三省”与“长三角”人才开发合作协议》。六省（市）及省辖市（地）、县（市）人才中心提供的以人事档案为依据的各类证明互认有效，六省（市）省级人事部门主持并发证的专业技术资格互认有效，六省（市）及省辖市（地）、县（市）范围内，政府人事部门发放的继续教育资格证书互认有效。建立人事代理互助制度，为到合作区域工作的各类人才提供相关人事代理服务。适时联合举办网上人才交流大会，促进各类人才合理流动。
2016年，为深入贯彻落实《京津冀协同发展规划纲要》，加快京津冀人力社保一体化发展，天津、北京、河北三地人力社保部门共同签署了《京津冀专业技术人员职称资格互认协议》，互认专业技术人员职业资格证书、职称评审证书。