同年9 月，武汉国民政府警卫团参加毛泽东领导的湘赣边界秋收起义。中共湖南省委前委将位于修水、铜鼓、安源等地的武装，统一编成工农革命军第１军第１师，全师共5000余人，由卢德铭任总指挥，余洒度任师长，下辖3个团。曾士峨先在1团，后编入3团任3营参谋长。起义后，部队在战斗中几经挫折，总指挥卢德铭战死，前委书记毛泽东在文家市收集残部，决定向罗霄山脉中段的井冈山转移。当时起义部队中疟疾蔓延，一些人悲观动摇，脱离队伍逃跑，师长余洒度也开了小差。而负伤的曾士峨和张子清、罗荣桓、何长工等相互鼓励，坚决跟随毛泽东。南进途中，在泸溪又受到敌人伏击，部队一共剩下不到一千人，9月29日到达江西永新县境的三湾村。进村的当晚，毛泽东在“泰和祥”杂货铺召开中共前敌委员会扩大会议，讨论部队现状及其解决的措施，决定对部队实行整顿和改编，这就是著名的三湾改编。

通过三湾改编，党的组织在部队形成了系统，党支部掌握了基层，党对军队领导的制度得以确立。但当时毛泽东的身份是前委书记，不直接指挥队伍。加之兵官来自不同的地方，形势又恶劣，难以掌握。毛泽东是最高政治领导，其余干部多数是黄埔生，少数行伍军官任副职。毛泽东的军事天才要到以后才大放光芒，此时，不少人并不了解他、也不是从内心里信任他。部队的骨干是从武汉国民警卫团过来的一批人马，受过正规军事训练，包括曾士峨在内的许多军人还经历了北伐战争硝烟的考验。在这样的关头，立场坚定的宛希先、何挺颖、曾士峨、罗荣桓等人稳定了这支队伍，紧紧跟随毛泽东。

不久后，成立了特务连。毛泽东慧眼识珠，选中了军事素质和政治素质都十分拔尖的曾士峨担任连长。所谓特务连就是在行军作战中执行特殊任务的连队，探敌情、当尖刀，担任警卫，有以一当十的战斗力。当时工农革命军总共才七个连，曾士峨连是力量最强的，曾士峨本人是1926年的共产党员，党代表罗荣桓、副连长张宗逊也是中共党员，革命意志坚定，政治上靠得住。从永新三湾经古城、宁冈、茅坪，再上井冈，特务连基本上派出一个排担任毛泽东的警卫工作，行军打仗，毛泽东和特务连脱离的时候很少。

上井冈山后，曾士峨、罗荣桓率特务连随一营于1927年11月18日攻占茶陵，红军在这里建立了中国第一个县工农兵政府。在井冈山，宛希先、张子清、何挺颖和曾士峨、罗荣桓一起，对企图暗地拉部队投敌的陈浩、徐庶、韩剑壮等人的叛变行为，进行了坚决斗争。1928年5月，秋收起义和南昌起义的部队会师宁冈，毛泽东、朱德、陈毅在龙书院文昌阁会晤，曾士峨率部担任了保卫工作。

从1927年到1931年，曾士峨率部转战闽赣，历经恶战数十次，小战难以胜计，冲锋在前，无坚不摧，多次负伤，立下了赫赫战功。由于才华突出，曾士峨屡获提拔，从连长、营参谋长、支队长，升至纵队司令员、师长和军参谋长。毛泽东井冈山的驻地，就是曾士峨的警卫连扎营的地方。曾士峨的二纵和以后的11师，也成了毛泽东最为倚重和最喜欢使用的一支主力部队。1929年秋，他在一封给亲友的信中，这样写道：“离家四载有余，虽奔波南北，历尽千辛，然为大众之生息，常感无形的快慰”，展示了他作为一名革命者的高尚情怀。

军中虎将